Alla scuola per fate di Alfea le Winx, senza Bloom che sta vivendo la sua vita da principessa su Domino, sono costrette a fronteggiare le perfide Trix che hanno rubato un potentissimo oggetto misterioso. Nel frattempo, Bloom deve fare i conti con un oscuro segreto che grava sul regno di Eraklyon e che non le permette di sposare l'amato Sky. Quando le Antenate, con l'aiuto delle Trix, riescono a rintracciare l'Albero della Vita e a minare l'equilibrio tra la magia positiva e quella negativa, Bloom e le sue amiche si riuniranno per ristabilire l'ordine e scoprire il segreto che grava su Sky...