Dopo il terribile massacro della sua famiglia ad opera del freddo mercenario Sub-Zero, Hanzo Hasashi viene esiliato nel Nether Realm. Lì, in cambio del servire il sinistro Quan Chi, gli viene data una chance di vendicare la sua famiglia - e viene riportato in vita come Scorpion, un'anima perduta dedicata alla vendetta. Nel Regno della Terra, Lord Raiden raduna una squadra di guerrieri d'élite - il monaco Shaolin Liu Kang, l'ufficiale delle forze speciali Sonya Blade e la stella del cinema Johnny Cage - un'improbabile compagine di eroi con il compito di salvare l'umanità. Per farlo, devono sconfiggere le orde di gladiatori del Regno Esterno di Shang Tsung e diventare campioni del torneo di Mortal Kombat...