Quando era un giovane soldato, Jason Bourne, dopo aver saputo che suo padre era stato ucciso da terroristi si offrì volontario per un programma sperimentale e fu trasformato in un'arma umana da 100 milioni di dollari. Tuttavia, secondo i progettisti l'arma si rivelò difettosa e quindi cercarono di toglierlo di mezzo. Anni dopo, scoperta la sua vera identità, Jason ha raggiunto una pace apparente e ha fatto perdere le sue tracce per sempre. Fino a quando un'organizzazione molto più pericolosa di qualsiasi governo riporta Bourne nuovamente in azione...