Quando, a causa di un incidente avvenuto durante un concerto, Dave Seville finisce all'ospedale, i Chipmunks, star indiscusse della musica pop, vengono affidati alle cure di Toby, suo nipote ventenne. Alvin, Simon e Theodore dovranno accantonare per un po' la fama e le tournée per tornare sui banchi di scuola. Coinvolti in un concorso per band musicali, i Chipmunks scopriranno ben presto di doversi scontrare contro le "Chipette", una band tutta al femminile composta da tre graziose scoiattoline, Brittany, Eleanor e Jeanette. La competizione ha inizio e le "scintille" non mancheranno...